《Science》:三分鐘速讀精彩文獻

 

Science,科學

 

1.N6,2'-O-二甲基腺苷(m6Am)發生和功能研究

 

N6-甲基腺苷(m6A)是mRNA的主要修飾,在RNA代謝和功能中起關鍵作用。?除內部m6A外,N6,2'-O-二甲基腺苷(m6Am)存在于脊椎動物的加帽mRNA的轉錄起始核苷酸中。?然而,它的生物發生和功能作用仍然難以捉摸。?使用反向遺傳學方法,本研究鑒定了PCIF1,一種與RNA聚合酶II的Ser5-磷酸化C-末端結構域相互作用的因子,作為負責m6Am的N6-甲基化的帽特異性腺苷甲基轉移酶(CAPAM)。?CAPAM與底物復合物的晶體結構揭示了帽特異性m6A形成的分子基礎。?轉錄組范圍的分析顯示m6Am的N6-甲基化促進了加帽的mRNA的翻譯。?因此,帽特異性m6A編寫者從m6Am開始促進mRNA的翻譯。[1]

 

二甲基腺苷

Figure 1 Comprehensive analysis of mRNA 5′-terminal modification.

 

2.單細胞多組學測序分析人結直腸癌

 

為了更好地設計癌癥治療方法,了解腫瘤的異質性,對幫助癌癥轉移是非常重要的。為了研究這個過程,湯富酬等課題組使用單細胞三聯組學測序(scTrio-seq)技術檢查來自10個個體患者的結腸直腸癌腫瘤和轉移瘤中的突變,轉錄組和甲基化組。該分析提供了腫瘤進化的見解,將DNA甲基化與遺傳譜系聯系起來,并且顯示DNA甲基化水平在譜系內是一致的,但在克隆中可以顯著不同。

 

雖然基因組不穩定性,表觀遺傳異常和基因表達失調是結腸直腸癌的標志,但這些特征尚未在單細胞分辨率下同時進行分析。使用優化的單細胞多組學測序以及原發腫瘤和淋巴和遠處轉移的多區域采樣,研究者開發了超出腫瘤內異質性的見解。全基因組DNA甲基化水平在單個遺傳亞系內相對一致。在測序的DNA的所有10名患者中,癌細胞的全基因組DNA去甲基化模式是一致的。癌細胞的DNA去甲基化程度明顯與正常組織的異染色質相關組蛋白修飾H3K9me3的密度和重復元素長散在的核元件1的密度相關。本工作證明了使用單細胞多組學重建遺傳譜系和追蹤其表觀基因組和轉錄組學動態的可行性。[6]

 

單細胞多組學測序

Figure 4? Reconstruction of genetic lineages with scTrio-seq2.

 

3.非組蛋白乙酰化的功能和機制

 

Nε-賴氨酸乙酰化在半個多世紀以前被發現作為組蛋白的翻譯后修飾,并且已經在轉錄調節的背景下進行了廣泛研究。在過去十年中,蛋白質組學分析顯示非組蛋白經常被乙酰化并構成哺乳動物細胞中乙酰基的主要部分。實際上,非組蛋白乙酰化涉及與生理學和疾病相關的關鍵細胞過程,例如基因轉錄,DNA損傷修復,細胞分裂,信號轉導,蛋白質折疊,自噬和代謝。乙酰化通過多種機制影響蛋白質功能,包括通過調節蛋白質穩定性,酶活性,亞細胞定位和與其他翻譯后修飾的串擾以及通過控制蛋白質?- 蛋白質和蛋白質-DNA相互作用。在本綜述中,作者討論了目前對非組蛋白乙酰化的范圍,功能多樣性和機制的理解的最新進展。[2]

 

非組蛋白乙酰化

Figure 2 Regulation of reversible lysine acetylation.

 

文獻來源:

 

1.From Science,Cap-specific terminal N6-methylation of RNA by an RNA polymerase II–associated methyltransferase. DOI: 10.1126/science.aav0080

 

2.From Science,Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer. DOI: 10.1126/science.aao3791

 

3.From Nature Reviews Molecular Cell Biology,Functions and mechanisms of non-histone protein acetylation. DOI: https://doi.org/10.1038/s41580-018-0081-3

 

艾美捷

每日生物評論
二胺氧化酶(DAO)活性檢測試劑盒

發表評論

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: