病毒RNA?m6A修飾—病毒RNA分離快速試劑盒解決方案

 

前期回顧:SARS-CoV-2靶向檢測試劑盒相關研究

 

光陰似箭,日月如梭,時間箭矢從過去“嗖”的一下來到了中國農歷2020年的年末,想想還有半個月就要過年了,大家是否在期待“爆竹聲中辭舊歲”呢?雖然現在禁止放煙花爆竹~~~不過,就今年而言,我想現在大家更多的是想爆竹聲中病毒除吧——新冠病毒。雖然該病毒從未完全消滅過,但是現在的卷土而來,并且來勢洶洶導致很多人都沒有辦法回到老家與家人團圓,同時也限制了我們的出行和吃穿方面,小編過年是要回老家的,回家就要做核酸檢測,昨天在網上預約核酸檢測,很多檢測機構到7號都預約滿了,心累。也真心希望在牛年里,病毒能夠真的被除去了。

 

說到病毒,拿我們現在賊討厭的新冠病毒COVID-19: SARS-coV-2來舉例,它的遺傳物質是RNA。如果SARS-CoV-2大流行給我們帶來了任何啟示,那么對RNA修飾的研究現在比以往任何時候都更加重要。 這是否意味著要研究病毒RNA本身以更多地了解不同的改變和表觀遺傳學變化如何使這些病毒更具彈性和更具感染力,或者研究從細胞和組織中收集的RNA以了解這些不同病原體對宿主細胞功能的影響,這項研究努力幾乎是無盡的。RNA m6A的原理和概念我今日就不再贅述,今天就開門見山的聊聊病毒 RNA m6A.

 

一 m6A修飾對RNA病毒生命周期的影響

 

已知表觀遺傳修飾會影響人冠狀病毒等RNA病毒的生命周期。據報道,像N6-甲基腺苷(m6A)這樣的修飾腺苷通過調節病毒帽結構、病毒基因表達、病毒子代、先天性感應途徑和先天性免疫反應來影響特定RNA病毒的生存能力。m6A的獲得或喪失可導致RNA病毒發生顯著的功能變化,改變宿主細胞的融合/進入、復制、傳播、病原體強度和免疫逃避。宿主細胞的m6A表型組在宿主抵抗力中起著重要作用,病毒感染后也可發生改變。SARS-CoV-2基因組長度超過29800個核苷酸,根據RNA甲基化酶復合物METTL3/14對m6A修飾的特定序列座的存在,包括GGACU(T)、GGACA和GGACC,包含50多個潛在的m6A位點。因此,SARS-CoV-2 RNA中>0.64%的腺苷,或0.18%的堿基可能是m6A。因此,總RNA中m6A的定量和全轉錄組m6A圖譜的繪制對于研究m6A相關的病毒功能和相應的機制,以及確定新的抗病毒治療靶點至關重要。

 

二 病毒RNA提取

 

無論您是從細胞,組織還是病毒的樣品開始,有效的RNA分離通常是成功進行實驗的第一步。對于病毒:另一方面,當涉及病毒樣品時,諸如病毒滴度低和污染性宿主核酸的高存在之類的挑戰需要使用補充技術來確保產量和純度符合下游要求。在我們最近的公告文章中,我們概述了可以完成此操作的10種方法(欲知更多詳情,請咨詢小艾獲取喲),因此您可以將其應用到最適合您的學習的方法中。一種方法是接種細胞培養物進行病毒擴增,然后收集擴增的病毒體,以與EpiGentek的病毒RNA提取試劑盒一起使用。注意:對于直接從臨床標本中提取的病毒RNA,在m6A RNA富集之前,需要額外的處理以去除共提取的宿主DNA和rRNA污染物。

 

三 病毒RNA提取試劑盒

 

病毒RNA提取產品我們主要有2種:RNA穩健的旋轉柱和磁性試劑盒我們的每一個試劑盒都是為了提取高質量的RNA而設計的,除了用于RT-PCR之外,還可以用于其他下游應用。我們的試劑盒在提取方法以及通量選項(高/手動)的類型上有所不同,因此無論您的實驗室需要什么,我們的試劑盒都可以幫助您獲得隨時可用的純化病毒RNA。我們的各種磁珠和自旋柱試劑盒可以從不同的樣品來源(鼻腔/鼻咽拭子、細胞/組織)和物種(病毒、哺乳動物)中分離RNA。洗滌劑和潮解鹽用于裂解細胞和滅活RN酶。專門的高鹽緩沖系統使RNA堿基與磁珠結合到自旋柱的玻璃纖維基質上,同時污染物被有效地洗去。純核酸用水緩沖液洗脫,不需要苯酚提取或酒精沉淀。具體操作流程如下:

 

病毒RNA提取試劑盒操作流程

 

產品:

貨號 產品名稱 描述
P-9107
(旋轉柱)
EpiQuik Viral RNA Isolation Fast Kit ?EpiQuik病毒RNA分離快速試劑盒是一整套優化的緩沖液和試劑,適用于從無細胞液體樣本(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA。旋轉柱法純化。10min。
P-9108
(磁珠法)
EpiMag Viral RNA Isolation Kit (Magnetic Beads) 適用于從無細胞液體樣品(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA,磁珠法,25min。
P-9109
(磁珠法)
EpiMag 96-Well Viral RNA Extraction Kit (High Throughput) 適用于從無細胞液體樣品(不含血漿和血清)中制備磁珠,以高通量方式快速制備病毒RNA。 ),高通量,磁珠法,30min。

 

結果:

P-9107

P-9107

 

p-9108:

p-9108

 

p-9109:

p-9109

 

以上便是本期全部內容,大家想要了解更多病毒RNA提取和純化方面的信息,請咨詢小艾喲!

 

下期為大家帶來病毒RNA m6A甲基化研究方面的產品和信息,敬請期待~~

 

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作為一家具有高端的技術實力、先進的經營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業,總部位于武漢光谷高新技術開發區,服務面向全國。艾美捷科技是集進口試劑、實驗室耗材銷售、技術服務與合約開發為一體的專業化高科技公司,為用戶提供專業的前沿資訊、完備的產品、整合的解決方案,及優質的物流服務。為了更好的服務客戶,公司組建了一支經驗豐富的研發團隊-艾美捷生物技術中心,進入研發生產階段,將更優質的產品推薦給國內生物領域的同仁們!

 

艾美捷科技與國內外優秀的生物試劑供應商優保持著密切的合作關系,目前已成為眾多國際知名品牌的中國總代理或一級代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Abbexa、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、ImmunoReagents、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、Mabtech、Matreya、Norgen Biotek、Origene 、ProSpec、ProImmune、StressMarq、ScyTek 、SouthernBiotech、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短時間內為用戶提供專業的前沿資訊、完備的產品及物流服務。

 

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